Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC9Q6ZRR7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms