Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms