Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB0

VWA1, von Willebrand factor A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA1Q6PCB0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA1Q6PCB0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms