Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF38BQ5VTL8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms