Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms