Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A3Q5K4L6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms