Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF628Q5EBL2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms