Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8Q15843 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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