Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPAQ15257 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms