Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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