Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms