Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFTN1Q14699 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms