Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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