Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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COL9A2Q14055 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL9A2Q14055 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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