Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPSQ13938 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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