Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms