Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLEQ07864 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLEQ07864 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms