Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP2BQ02880 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms