Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms