Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms