Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms