Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms