Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF6P62330 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms