Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF4A1P60842 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A1P60842 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms