Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms