Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP7P55210 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP7P55210 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms