Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA4P51532 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms