Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LINC01096-201ENST00000501050 1263 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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HOXD11P31277 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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