Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms