Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA6P31267 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms