Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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HOXD10P28358 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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HOXD10P28358 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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HOXD10P28358 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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HOXD10P28358 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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HOXD10P28358 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD10P28358 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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