Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2AP24928 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms