Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME1P15531 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME1P15531 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME1P15531 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME1P15531 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NME1P15531 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms