Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms