Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms