Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOX1O75936 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms