Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms