Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms