Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNMO15061 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNMO15061 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNMO15061 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms