Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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