Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms