Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SH2D7A6NKC9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH2D7A6NKC9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms