Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms