Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GGA1Q9UJY5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GGA1Q9UJY5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms