Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.51■■■□□ 2
MLH3Q9UHC1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH3Q9UHC1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms