Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A12Q9NXJ0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms