Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms