Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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