Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms