Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRIP1Q9BX63 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms